L'iniziativa ha però suscitato l'opposizione di certi ambienti, in particolare perché la Commissione nazionale istituita per la Convenzione delle Alpi non è stata preventivamente consultata dal Ministero dell'ambiente. Per questo in Francia è saltato il calendario originario, secondo il quale l'Assemblea nazionale avrebbe dovuto approvare la ratifica il 29 novembre e il Senato ancora entro la fine dell'anno.
Nel Principato di Monaco il 3 febbraio 2005, dopo i protocolli Pianificazione territoriale e sviluppo sostenibile, Turismo, Difesa del suolo e Composizione delle controversie, entrerà in vigore anche il protocollo Protezione della natura e tutela del paesaggio, dopo che il relativo strumento di ratifica è stato depositato il 3 novembre 2004.